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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

重庆2023年将为近18万名适龄在校女学生免费接种HPV疫苗******

　　中新网重庆1月17日电 (记者 刘相琳)记者17日从重庆市发展改革委获悉，2023年重庆15件重点民生实事出台，其中将为近18万名适龄在校女学生免费接种HPV疫苗，实现愿接尽接。

　　据介绍，2023年，重庆继续实施9件重点民生实事，包括继续实施城镇老旧小区改造和社区服务提升、发展普惠性学前教育、发展婴幼儿照护服务、推进义务教育阶段学生“双减”、青少年心理健康教育、开展“百千万惠残助残行动”、中心城区轨道站步行便捷性提升、实施农村公路生命安全防护工程、“劳动者港湾”示范点建设。

　　同时调整充实3件重点民生实事。根据国家有关部委要求，结合民众意愿，将“建设社区体育文化公园”调整为“建设城市公园”，充实口袋公园建设内容；将“实施街头绿地提质工程”调整为“实施城市绿荫工程”，充实山城绿道建设内容；将“中心城区小微停车场建设”调整为“小微停车场建设”，覆盖范围从中心城区扩大到全市所有区县。

　　重庆市发展改革委称，考虑老年人照顾服务计划、农村社区居家养老服务全覆盖工程、中心城区人行道完善提升等3件重点民生实事即将完成阶段性目标任务，实现销号，2023年，新增补适龄女性免费接种HPV疫苗、公益性殡葬服务设施建设、地下“有限空间”安全监测整治等3件重点民生实事。(完)

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　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）